Cronologicamente Deus Ex 3 è situato prima di Deus Ex e Deus Ex: Invisible War, ossia nell'anno 2027 (rispetto a Deus Ex ambientato invece nell'anno 2052) quando la tecnologia degli aggiornamenti biomeccanici era ancora agli albori. Il protagonista é Adam Jensen.

Nella fabbrica dove lavora Jensen,ci sarà un attacco terroristico,dove moriranno tutti tranne lui.Lo scopo del gioco sarà riuscire a capire chi,come e perchè ha fatto questo.In questo seguito avranno un ruolo fondamentale anche le donne da cui potremmo essere sedotti o traditi a seconda delle azioni che abbiamo fatto in passato.Nel gioco sarà a volte anche presente un diario del protagonista,che attraverso le pagine e i flashback riuscirà a far luce su questo mistero.Consigliato per chi ama i giochi di ruolo